偃松 PpSS 和 PpSE 基因克隆及序列分析
王思瑶1,2 ，于宏影 1,2* ，刘 洋1 ，李翊宁1 ，周 鑫 1 ，南 方1
1. 国家林业和草原局哈尔滨林业机械研究所，哈尔滨 150086；2. 中国林业科学研究院寒温带林业研究中心，哈尔滨 150086
Cloning and Sequence Analysis of PpSS and PpSE Genes in Pinus pumila
WANG Si-yao1,2 ， YU Hong-ying1,2/ ， LIU Yang1 ， LI Yi-ning1 ， ZHOU Xin1 ， NAN Fang1
1. Harbin Research Institute of Forestry Machinery，National Forestry and Grassland Administration，Harbin 150086；2. Research Center of Cold Temperate Forestry，CAF，Harbin 150086
文章导读
摘要 【目的】克隆偃松甾醇代谢途径关键基因 SS 和 SE，为促进偃松甾醇高效合成奠定基础，为药用偃松遗传改良提供重要基因资源。【方法】利用偃松 RNA-Seq 数据筛选偃松 SS 和 SE 基因并克隆，通过生物信息网站及软件对其进行序列分析。【结果】从偃松中克隆 2 个甾醇代谢途径关键基因 SS 和 SE，分别属于 SS 和 SE 基因家族，命名为 PpSS 和 PpSE。二者均具有完整的开放读码框（ORF），分别长 1 230bp 和 1 647bp，编码 409 和 548 个氨基酸。PpSS 编码的氨基酸序列与马尾松 SS 家族蛋白（GenBankID：AHI96421.11）相似度最高，为 95.11%， PpSE 编码的氨基酸序列与银杏 SE 家族蛋白（GenBankID：AVG44184.1）相似度最高，为 80.98%。PpSS 蛋白存一个异戊二烯合成酶 C1 超家族位点，PpSE 蛋白存在一个鲨烯单加氧酶超家族位点。【结论】 PpSS 和 PpSE 分别为偃松 SS 和 SE 基因家族中的新基因，两个基因的获得为进一步挖掘其在偃松甾醇代谢中的调控机制研究奠定了基础。
关键词 ：
偃松 ,
SS ,
SE ,
克隆
收稿日期: 2022-12-12
基金资助: 新兴食用油料树种种质资源调查收集（2019FY100802-06）
作者简介 : 王思瑶（1992—），女，硕士，研究实习员，主要研究方向：林木遗传育种。
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