偃松种子萌发实时定量 PCR 内参基因的筛选
王思瑶,于宏影* ,丛日征,闫晓娜,裴晓娜
国家林业和草原局哈尔滨林业机械研究所,哈尔滨, 150086;中国林业科学研究院寒温带林业研究中心,哈尔滨, 150086
Selection of the Reference Genes for Gene Expression Studies in Seed Germination of Pinus pumila by Real-time Quantitative PCR
WANG Si-yao, YU Hong-ying * , CONG Ri-zheng, YAN Xiao-na, PEI Xiao-na
Harbin Research Institute of Forestry Machinery,National Forestry and Grassland Administration,Harbin 150086;Research Center of Cold Temperate Forestry,CAF,Harbin 150086
文章导读
摘要 【目的】寻找偃松种子萌发过程的内参基因,为研究偃松种子萌发过程提供必要的分子生物学基础,丰富偃松基因资源。【方法】利用偃松种子萌发 RNA-Seq 数据筛选偃松部分常用内参基因,根据内参基因选用标准并利用 NCBI 网站进行进一步筛选。【结果】筛选得到 6 种传统的内参基因,分别为 eIF 、 RPS3、 TBP、 EF-1α、 ACT、GAPDH。根据实验室前期转录组分析结果显示,这些基因在此过程中稳定表达。【结论】找到了偃松种子萌发过程中的部分内参基因,但其表达趋势有待于进一步的实验验证。
关键词 :
偃松 ,
内参基因 ,
荧光定量 PCR ,
种子萌发
收稿日期: 2021-08-15
基金资助: 林木遗传育种国家重点实验室开放基金(K2019105)
通讯作者:
于宏影(1989—),女,硕士,工程师,主要研究方向:林木遗传改良。E-mail:846235592@qq.com。
E-mail: E-mail:346043844@qq.com
作者简介 : 王思瑶(1992—),女,硕士,研究实习员,主要研究方向:林木遗传育种。
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