DNA条形码在昆虫学中的研究概况

doi:10. 3969 /j. issn. 2096-4900. 2020. 03.004

温带林业研究

2020, Vol. 3

Issue (3): 15-20 DOI: 10. 3969 /j. issn. 2096-4900. 2020. 03.004

综合评述

本期目录 | 过刊浏览 | 高级检索

DNA条形码在昆虫学中的研究概况

陈梦义 ^1*，何万存¹，郝德君²

1.江西省林木育种中心，南昌 330038；2.南京林业大学，南京 210037

The Research of DNA Barcoding in Entomological

CHEN Meng-yi^1*，HE Wan-cun¹，HAO De-jun²

1.Forest Tree Breeding Cente of Jiangxi Province，Nanchang 330038；2.Nanjing Forestry University，Nanjing 210037

摘要
图/表
参考文献
相关文章 (3)

全文: PDF (848 KB) HTML (1 KB)
输出: BibTeX | EndNote (RIS) 背景资料

文章导读

摘要昆虫 DNA 条形码序列（DNA Barcoding）检测鉴定技术是利用昆虫的一个或多个 mtDNA、rDNA 片段碱基序列的差异对昆虫进行分类阶元、种下阶元遗传进化分析的一项分子生物学方面的数字化检测技术。这一技术给昆虫分类鉴定、种群分化分析、隐存种、新种的发现提供了新的技术参考手段。现阶段 DNA 条形码中部分片段的基因序列已在昆虫分子生物学研究中得到了广泛的应用，在新时代信息化发展的今天，昆虫 DNA 条形码检测技术对昆虫分类学影响较大，具有重要的理论和现实意义；相对的，由于昆虫种类繁多，同种中存在雌雄二型现象、不同地里种等问题，使部分种类遗传系统发育研究结果与形态学相搏，故 DNA 条形码技术单纯依靠序列碱基差异分析结果存在一定的局限性，因此一个可靠的分析研究结果是应与传统形态学相结合的。本文主要阐述了 DNA 条形码技术原理，相关基因序列种类，并详细介绍了 CO Ⅰ、CO Ⅱ、Cytb、18S rRNA、28S rRNA 等基因序列的特点和应用昆虫种类的研究，简要讨论和展望 DNA 条形码技术在昆虫分子生物学中的应用前景。

	服务

	把本文推荐给朋友
	加入我的书架
	加入引用管理器
	E-mail Alert
	RSS
	作者相关文章
	陈梦义
	何万存
	郝德君

关键词 ： DNA 条形码, 昆虫, 基因序列

收稿日期: 2020-06-09

PACS:

S763.3

基金资助:江西林业科技创新专项“赣东北低山丘陵油橄榄引种栽培与优良品种筛选评价研究”（[2020]07）。

作者简介: 陈梦义（1990—），男，工程师，主要研究方向：森林保护学。

引用本文:

陈梦义，何万存，郝德君. DNA条形码在昆虫学中的研究概况[J]. 温带林业研究, 2020, 3(3): 15-20.
CHEN Meng-yi，HE Wan-cun，HAO De-jun. The Research of DNA Barcoding in Entomological. 温带林业研究, 2020, 3(3): 15-20.

链接本文:

http://www.wdlyyj.cn/CN/10. 3969 /j. issn. 2096-4900. 2020. 03.004 或 http://www.wdlyyj.cn/CN/Y2020/V3/I3/15

[1]Swofford D L， Olsen G J， Hillis D M. Phylogeny inference In ： Hillis D M， Moritz B K（ eds）. Molecular systematics [M]. Sunderland ： Sinauer Associates，1996 ：403-503.
[2] 徐庆刚，花保祯 . 线粒体 DNA 在昆虫系统学研究中的应用 [J]. 西北农林科技大学学报：自然科学版，2001，8：79-83.
[3] Hebert P D N， Ratnasingham S， deWaard J R. Barcoding animal life ： Cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species[J]. Proceedings of the Royal Society of London series B ： Biological Science，2003，270 ： S96-S99.
[4] Hajibabaei M， Singer G A， Hebert P D N. DNA barcoding ：how it complements taxonomy， molecular phylogenetics and population genetics[J]. Trends in Genetics，2007，23（4）：167-172.
[5] Frézal L， Leblois R. Four years of DNA barcoding：current advances and prospect[J]. Infection，Genetics and Evolution，2008，8：727-736.
[6] Galimberti A， De Mattia F， Losa A， et al. DNA barcoding as a new tool for food traceability[J]. Food Research International，2013，50：55-63.
[7] 王德明，林杨 . 线粒体 DNA 基因序列在昆虫分子系统学研究中的应用 [J]. 广东农业科学，2010，6 ：188-190.
[8] 刘殿锋，蒋国芳 . 核基因序列在昆虫分子系统学上的应用 [J]. 动物分类学报，2005，30（3）：484-492.
[9] Chintauan-Marquier I C，Legendre, Frédéric，Hugel S，et al. Laying the foundations of evolutionary and systematic studies in crickets（Insecta，Orthoptera）：a multilocus phylogenetic analysis[J]. Cladistics-the International Journal of the Willi Hennig Society，2016，32（1）：54-81.
[10] Chang Gyu-Dong， Lee Seon-Mi， Kim Jin-Hee，et al. DNA Barcoding for Reveal a Possible New Species of Anurophorus（Collembola：Isotomidae）Associated with Korean Fir（ Abies koreana Wilson） [J]. Journal of AsiaPacifi c Biodiversity，2020.
[11] Ji Y，Yu X. Molecular test shows the color pattern is not so reliable in diagnostic of genus Dysphaea Selys（Odonata：Euphaeidae） [J]. Zoological Systematics，2019，44（2）：91-99.
[12] 郝桂英，杨光友，古小彬 . 基于线粒体 CO Ⅱ基因的33株细颈囊尾蚴分离株种系发育关系分析 [J]. 中国兽医科学，2011，41（7）：684-690.
[13] 李芳芳，陈学新，朴美花，等 . 基于 28SrRNA 基因 D2序列的优茧蜂亚科分子系统发育（膜翅目：茧蜂科） [J]. 昆虫分类学报，2003，25（3）：217-226.
[14] Muccio T D， Marinucci M， Frusteri L， et al. Phylogenetic analysis of Phlebotomus species belonging to the subgenus Larroussius（ Diptera， Psychodidae） by ITS2 rDNA sequences[J]. Insect Biochemistry and Molecular Biology，2000，30（5）：387-393.
[15] Sima Y H， Chen M， Yao R， et al. The complete mitochondrial genome of the Ailanthus silkmoth，Samia cynthia cynthia (Lepidoptera: Saturniidae)[J]. Gene，2013，526（2）.
[16] 叶碧欢，李海波，叶卫邦，等 . 锈色粒肩天牛幼虫的CO Ⅰ、 CO Ⅱ、 Cytb 和 28S 基因片段序列分析 [J]. 浙江农林大学学报，2020，37（2）：303-310.
[17] 呼晓庆，杨兆富 . 基于线粒体 CO Ⅰ、 Cytb 和 CO Ⅱ基因的中国草地螟不同地理种群遗传分化分析 [J]. 昆虫学报，2019，62（6）：720-733.
[18] 魏久锋 . 中国圆盾蚧亚科分类研究（半翅目：盾蚧科）[D]. 杨凌：西北农林科技大学，2011.
[19] 刘殿锋 . 应用 18S rDNA 和 16S rDNA 序列研究蝗总科昆虫的系统进化 [D]. 南京：南京师范大学，2005.
[20] Dawnay N， Ogden R， Mcewing R，et al. Validation of the barcoding gene CO Ⅰ for use in forensic genetic species identification[J]. Forensic ence International，2007，173（1）：1-6.
[21] 晏毓晨，李泽建，黎桂鸿，等 . 危害短梗稠李的中国丑锤角叶蜂属（膜翅目：锤角叶蜂科）一新种 [J]. 林业科学，2020，56（5）：105-112.
[22] 张鹏飞，周晓榕，庞保平，等 . 基于线粒体 CO Ⅰ基因序列的内蒙古沙葱萤叶甲种群遗传多样性及遗传分化[J]. 环境昆虫学报，2017，39（2）：332-341.
[23] 聂跃，卢塘飞，陈俊谕，等 . 基于 CO Ⅰ基因的橡胶树六点始叶螨遗传多样性分析 [J]. 热带作物学报，2020，41（4）：773-778.
[24] 常虹，郝德君，肖荣堂，等 . 基于线粒体 CO Ⅰ基因的齿小蠹属昆虫 DNA 条形码研究 [J]. 昆虫学报，2012，55（9）：1075-1081.
[25] 代金霞，张大治 . 叶甲亚科部分种类 CO Ⅱ基因序列分析及系统发育初探 [J]. 四川动物，2010，29（2）：193-196.
[26] Lydeard C， Roe K J. The phylogenetic utility of the mitochondrial Cytochrome b gene for inferring relationships among actinopterygian fishes. [M]//Kocher T D，Stepien C Aed. Molecular Systematic of Fish. Academic Press，NewYork，1997，285-303.
[27] 傅美兰，彭建军，王莹，等 . DNA 条形码技术的应用与分析 [J]. 河南师范大学学报，2010，38（4）：118-122.
[28] Rortais A， Arnold G， Alburaki M， et al. Review of the DraI COⅠ-COⅡ test for the conservation of the black honeybee（Apis mellifera mellifera）[J]. Conservation Genetics Resources，2011，3：383-391.
[29] Krosch M N，Schutze M K，Armstrong K F，et al. A molecular phylogeny for the Tribe Dacini（Diptera：Tephritidae）：Systematic and biogeographic implications[J]. Molecular Phylogenetics and Evolution，2012，64（3）：513-523.
[30] 谭文静 . 基于线粒体 CO Ⅰ、CO Ⅱ基因的云南省横坑切梢小蠹种群遗传结构研究 [D]. 昆明：云南大学，2019.
[31] Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequence[J]. Journal of Molecular Evolution，1980，16：111-120.
[32] Sperling F A H， Raske A G， Otvos I S. Mitochondrial DNA sequence variation among populations and host races of Lambdina fi scellaria（Gn）（Lepidoptera：Geometridae）[J]. Insect Molecular Biology，1999，8 ：97-106.
[33] 季英华，史文琦，乐文静，等 . 不同地理种群灰飞虱基于 CO Ⅱ基因的系统发育分析 [J]. 江苏农业学报，2010，26（3）：499-502.
[34] Meyer A， Wilson A C. Origin of tetrapods inferred from their mitochondrial DNA affi liation to lungfi sh[J]. Journal of Molecular Evolution，1990，31（5）：359-364.
[35] 杨瑞生，顾羽健，陈玉波，等 . 柞蚕饰腹寄蝇基于线粒体 Cytb 基因的种群变异及系统进化分析 [J]. 蚕业科学，2019，45（4）：509-516.
[36] Gilarriortua M， Salona Bordas M I， Cainé Laura M， et al. Cytochrome b as a useful tool for the identification of blowfl ies of forensic interest（ Diptera， Calliphoridae）[J]. Forensic Science International，2013，228（1-3）：132-136.
[37] 戴金霞 . 线粒体 Cytb 基因与昆虫分子系统学研究 [J]. 四川动物 . 2005，24（2）：222-225.
[38] Teixeira G A， Barros， Luísa Ant?nia Campos，De Aguiar H J A C，et al. Comparative physical mapping of 18S rDNA in the karyotypes of six leafcutter ant species of the genera Atta and Acromyrmex（Formicidae ： Myrmicinae）[J]. Genetica，2017，145（4-5）.
[39] 贾晨曦 . 我国北方金龟科甲虫分子标记和系统发育研究[D]. 沈阳：沈阳大学，2014.
[40] Coleman A W. ITS2 is a double-edged tool for eukaryote evolutionary comparisons[J]. Trends in Genetics，2003，19（7）：370-375.
[41] 白映禄，薛玉丽，常芸，等 . 基于 rDNA ITS1 序列的甘肃省叶螨属 Tetranychus 和全爪螨属 Panonychus 种群的系统关系 [J]. 甘肃农业大学学报，2019，54（5）：128-134.
[42] 杜周和 . 基于 Bmamy2 基因的家蚕起源与分化研究 [D].重庆：西南大学，2009.
[43] 田嵩浩，赵慧婷，姜玉锁 . 基于核基因 EF-1α 的中国境内东方蜜蜂遗传分化 [J]. 泉州师范学院学报，2016，34（6）：22-26.
[44] 尚北晨 . 基于 mtDNA CO Ⅰ和 ND5 基因的香梨优斑螟种群遗传结构研究 [D]. 阿拉尔：塔里木大学，2018.
[45] Leavitt J R，Hiatt K D，Whiting M F， et al. Searching for the optimal data partitioning strategy in mitochondrial phylogenomics: A phylogeny of Acridoidea（Insecta：Orthoptera：Caelifera）as a case study[J]. Molecular Phylogenetics & Evolution，2013，67（2）：494-508.